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“秦始皇的生父是谁”这个问题，历经两千余年，仍然为人们津津乐道。虽然经过许多学者探究、考证，但是看起来依旧迷雾重重，对秦始皇到底姓“嬴”还是姓“吕”，人们依旧莫衷一是。
李开元先生说秦始皇的历史形象，是层层加码的糊涂账，并不为过——毕竟到太史公司马迁编修《史记》来记载这些人物的时候，他们的风流已经过去了一百多年，信息失真在所难免。
司马迁作为东方史学的“开山祖师”，在编撰《史记》时，自然会大量地考察不同的资料。这里就有一个问题，即资料的内容对历史上的同一件事很可能有不同的记载，这些资料应该如何取舍？一般认为，司马迁以身受宫刑来确保《史记》的真实性，他对资料的取舍还是值得我们信赖的。
可这就为后人研究秦始皇造成了极大的麻烦，因为在《秦始皇本纪》中，记载“秦始皇者，庄襄王子也。庄襄王为质子于赵，见吕不韦姬，悦而取之，生始皇”，而《吕不韦列传》中，则白纸黑字地写明“吕不韦取邯郸诸姬绝好善舞者与居，知有身。子楚从不韦饮，见而说之，因起为寿，请之。吕不韦怒，念业已破家为子楚，欲以钓奇，乃遂献其姬。姬自匿有身，至大期时，生子政”。这就难免让后人莫可名状的惶恐，这自相矛盾的记述，如何来解呢？
现代学者考察《史记》内容，得出如下结论：对于荒诞的资料，大约已经直接删除，而可信度不高却有价值者，被以异闻等形式保留下来——板上钉钉的那种史料，则多以本纪和表的形式记录。换句话说，吕不韦是嬴政生父的说法，纯属谣传。
不管《史记》如何记载，我们还是要有理智的分析，现在，来看看嬴政的父亲对他的态度。其父子异，字子楚，是秦孝文王嬴柱之子，秦昭王四十三年前后，被送入赵都邯郸为质，秦赵相约盟好。秦赵两国相互送“质子”，目的在于麻痹对方，双方积极地准备决战，子异的处境可想而知。吕不韦看中子异的政治潜力，与子异结好，送她赵姬，怀上嬴政。
转瞬长平之战爆发，赵国四十万大军被秦将白起坑杀，子异为赵人仇视，陷入死地。秦昭王五十年，子异在吕不韦的帮助下冒险逃出邯郸，回到秦国，嬴政则与赵姬隐藏于邯郸，不敢稍露形迹。此后，秦孝文王即位，秦赵和解，赵姬与嬴政得以被送回秦国。子异此时已经被立为王太子，遂以赵姬为太子正妻，嬴政为继承人。嬴政继秦国王位时，年仅十三岁，以赵姬、吕不韦辅政。由此可见，子异对嬴政的身份是从无怀疑的。
子异能够继秦王位，吕不韦在其中出力甚宏，没有吕不韦，他多半死在赵国。可他就算回到秦国，没有吕不韦说服芈氏家庭、华阳夫人支持，他还是当不了秦王。吕不韦如此出力，因为他的全部身家和抱负都已经投资在了子异的王室血脉上，如此一来，他如何敢对子异的血脉后人动手脚？
从秦始皇出生到他继位，从来没有人怀疑过其血统问题，佐以《史记》为证，秦始皇的生父是子异，是没有疑问的。