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先看一位朋友的留言。
回答问题之前得先指出问题中一个错误，问题中不应该是主监视者，而是监视者马诺夫，他和反监视者莫比乌斯以及世界铸造者阿尔菲斯是三兄弟。
主监视者英文为Monitor-Mind，格兰特.莫里森在2013年漫画《天地大重奏》中创造了主监视者体系，这个体系中主监视者就是至高无上的存在，这个体系包括监视者一族、曼卓拉克等人物，这个体系不太被其它的作者所认可，很少有作者应用这个体系的设定。
除了主监视者体系，DC还有两个最主要的体系，一个是源头体系，另一个是上帝体系。
源头体系的至高存在是源头，从1938年超人诞生开始，DC主宇宙基本上都处于源头体系之下。而监视者三兄弟和他们的母亲创世女神佩尔佩图阿就是这个体系之下的。
而上帝体系至高的存在就是上帝，通常眩晕漫画旗下的人物和事件都属于上帝体系，包括路西法、无尽家族、末日巡逻队、沼泽怪物等。
现在咱们说回问题本身，第一个问题DC宇宙的重启曼哈顿博士只参与了两次就是《闪点》和《末日警钟》，但是《末日警钟》的规模非常大包含或者说重现了历史上每一次重启，从这个角度来说曼哈顿博士也算是导演了每一次重启。
第二个问题，小祸认为曼哈顿博士是强于佩尔佩图阿的。小祸一直都是一个观点，论常态来说曼哈顿博士是至高神明一下的第一人。当然这是在源头体系的框架下，小祸一直都认为眩晕漫画大部分作品人物是不适合进行实力比较的。
下面小祸就来说一说曼哈顿博士的重启DC宇宙和他与佩尔佩图阿的实力。
DC宇宙经历过很多次重启，大规模的重启有1986年的《无限地球危机》、1994年《零时：时间危机》、2005年的《无限危机》、2011年的《闪点》、2016年的《DC宇宙重生》以及2018年的《末日警钟》。
除了大规模的重启，小的重启不计其数，例如2005年漫画《动作漫画》#825中毁灭日从天启星逃回地球，因为产生了感情，懂得了和平与爱，在超人大战高格时，毁灭日帮助超人大战高格的军队。
毁灭日与超人并肩作战
这并没能阻止超人被高格击败，之后毁灭日继承了超人的遗志，成为了世界上最伟大的英雄。
最伟大英雄毁灭日
超人被高格囚禁折磨了两百年，在毁灭日出现解救超人时，拒绝杀死高格，高格给了毁灭日一个选择，就是回到过去改变历史，但毁灭日也会重新变成一个怪物，于是毁灭日利用高格的能力回到过去改变了历史。
曼哈顿博士对DC宇宙的重启是有原因的，曼哈顿博士离开守望者宇宙来到了DC多元宇宙的“元宇宙（Metaverse）”.。所谓元宇宙简单理解就是DC多元宇宙的主宇宙，DC多元宇宙都围绕着主宇宙，随着元宇宙的改变而改变。
曼哈顿博士到达元宇宙是在1938年4月18日，不久超人诞生了，然后元宇宙出现了变化，超人消失了，在1956年才第一次出现，对应了白银时代的地球一取代了黄金时代地球二成为了主宇宙（这里有BUG，虽然白银时代开始于1956年，但是白银超人第一次出现是在1952漫画《超人》#176，而他作为超级男孩登场还要追溯到1945年《多趣漫画》#101）.
观察超人
随后，超人的诞生时间一直在变化对应了《无限地球危机》、《超人：天赋使命》、《超人：秘密起源》等事件和起源漫画中关于超人起源的改变。
从超人起源的变化曼哈顿博士发现了超人在元宇宙中的核心地位，他才决定重启DC宇宙来观察超人的变化。
也就是说，DC宇宙是现发生重启，曼哈顿博士感受到了重启，导致曼哈顿博士决定自己重启DC宇宙。
曼哈顿博士的这次重启DC宇宙就是2011年的大事件《闪点》，当然曼哈顿博士只是进行了一些微调，这次重启主要执行者是闪电侠巴里艾伦和邪恶三体的潘多拉。
其中闪电侠见证了闪点世界的崩坏，他再次奔跑阻止那个拯救自己母亲的自己。原本阻止之后，世界应该变成《闪点》发生之前的“新地球”，但是在世界改变的过程中潘多拉将眩晕宇宙和野风暴宇宙与新地球融合在了一起，形成了新52宇宙，而曼哈顿博士则在新52宇宙形成的过程中抽取了十年时间，造成了新52宇宙与“新地球”之间最大的区别，对DC宇宙所有人都造成了非常大的影响。
因为影响范围太大，这里小祸不能面面俱到的讲，所以只讲一些，首先就是抽取了十年时间，克拉克的养父母提早死亡，造成克拉克少年时期没有成为超级男孩，进而抹除了与超级男孩关系密切的未来三十一世纪的超级英雄军团。并且十年时间还包括超人与露易丝相知相爱的过程，导致二人没有相爱更没有结婚，等等，可以说超人的一生都在曼哈顿博士的操纵之下。
抹除超级男孩
绿灯侠阿兰.斯科特在1940年7月乘坐火车发生事故，事故中阿兰发现了星心制成的火车灯，因此成为了绿灯侠。但是新52宇宙中，这次事故发生时，在阿兰斯科特正要拿起火车灯时，曼哈顿博士拿走了火车灯，导致阿兰斯科特没能成为绿灯侠，死在了这次事故中，进而抹除了正义协会的所有成员。
曼哈顿拿走火车灯
用曼哈顿博士的话说就是“我改变过去以挑战未来”。
曼哈顿博士在观察超人的同时也在审视自己，他来到DC宇宙遇到的第一个人卡维尔.科尔曼在他的面前被谋杀，而他的做法与他在守望者宇宙一样，眼看着事情发生，却毫无作为。这种行为在DC宇宙被认定为邪恶，反观以超人为核心的DC宇宙则充满希望。
卡维尔死在曼哈顿面前
原本曼哈顿博士到达DC宇宙后观察到DC宇宙只有两个结局，一是宇宙被他毁灭，二是超人杀死曼哈顿博士。
但是超人给了他第三个选择，就是离开DC宇宙，在离开之前，曼哈顿博士再次重启了DC宇宙。
曼哈顿博士将绿灯侠的火车灯放回原处，阿兰斯科特成为了绿灯侠，进而恢复了正义协会。克拉克的养父母出车祸之前被克拉克救出，年少的克拉克成为了超级男孩，进而恢复了超级英雄军团。
重启后的DC多元宇宙一直在分裂，每一次变化都是在保存超人的每一个时代。
所以严格地说曼哈顿博士只重启了两次DC多元宇宙，第一次就是《闪点》，而第二次《末日警钟》则是规模最大的一次重启包含了历史上和未来会发生的所有多元宇宙。
佩尔佩图阿的定位是非常高的，在源头体系框架下，源头是至高无上的存在，在源头之下就是源头的判官和“手”，而佩尔佩图阿就是“手”之一。
“手”负责为源头创造多元宇宙，其中DC多元宇宙就是佩尔佩图阿创造的，在佩尔佩图阿被源头的判官封印在起源强之后，其他的“手”将DC多元宇宙进行了重启就是最初的多元宇宙，在《无限地球危机》中展示了“手”重启宇宙的场景。
在《黑夜：死亡金属》中几位“手”成员在一旁观察了获得团结之力的神奇女侠与至暗骑士的战斗，原本要在战斗之后毁灭DC多元宇宙的“手”受到神奇女侠的感召，只是重启了DC多元宇宙。
手观察战斗
虽然佩尔佩图阿被至暗骑士杀死了，但是从战斗过程可以看出，二人实力在同一档次，不存在档差的碾压。
至暗骑士大战创世女神
其实通过至暗骑士就可以看出曼哈顿博士的实力。
在黑暗多元宇宙中的某一个平行宇宙，布鲁斯.韦恩接触到了笑匠的徽章，感受到了徽章上曼哈顿博士的力量，于是他探寻这种能量。
他制造了一台与曼哈顿博士那次事故一样的机器，在布鲁斯.韦恩进入设备检查时，偷偷观察他的狂笑之蝠启动了机器，重现了曼哈顿博士获得能力的事故。
在布鲁斯.韦恩刚刚重组完成自己的身体后，狂笑之蝠偷袭了他，切除了他的脑叶，成为了植物人这个获得了曼哈顿能力的布鲁斯韦恩被狂笑之蝠带走，将他藏了起来。
布鲁斯被狂笑之蝠切除脑叶
在《黑夜：死亡金属》事件中，蝙蝠侠、神奇女侠等人杀死了狂笑之蝠，然而这都在狂笑之蝠的算计之中，狂笑之蝠安排手下将自己的尸体带到收藏拥有曼哈顿力量的布鲁斯韦恩藏身之地，让手下通过手术将自己的大脑移植在了拥有曼哈顿博士力量的布鲁斯韦恩身体里。
于是狂笑之蝠成为了拥有曼哈顿博士力量的至暗骑士。
狂笑之蝠获得曼哈顿力量
《黑夜：死亡金属》分为几条线索同时进行，其中佩尔佩图阿想要获得“危机能量”增强自己的力量。她在黑暗多元宇宙中创造了三个世界，一直进行《无限地球危机》、《无限危机》和《最终危机》，通过这些危机产生“危机能量”。
在上文提到的曼哈顿博士离开DC宇宙时，将连接能量留在了地球，被沃利韦斯特获得，沃利成为了神明一样的存在，甚至想要重启宇宙，但是被狂笑之蝠设计击败并囚禁。
沃利获得曼哈顿力量
为了打败佩尔佩图阿，英雄计划进入黑暗多元宇宙的三个危机世界，吸取“危机能量”然后传送给沃利.韦斯特。
然而这也在狂笑之蝠打的算计之中，狂笑之蝠吸收了“危机能量”，杀死了佩尔佩图阿。
所以狂笑之蝠之所以能够杀死佩尔佩图阿，是曼哈顿博士的力量加上“危机能量”的结果。
也就是曼哈顿博士 危机能量＞佩尔佩图阿，什么？难道没有危机能量的曼哈顿博士实力要弱于佩尔佩图阿？
当然不是，因为佩尔佩图阿也同样拥有危机能量，DC宇宙中发生的历次大事件都是由佩尔佩图阿的低声呢喃引发的。包括《无限地球危机》、《零时：时间危机》、《无限危机》、《最终危机》等等。历次危机都给予了佩尔佩图阿大量的“危机能量”。
佩尔佩图阿吸收危机能量
所有杀死了佩尔佩图阿的狂笑之蝠和佩尔佩图阿两人都去掉“危机能量”的因素，拥有曼哈顿博士力量的狂笑之蝠还是要强于佩尔佩图阿，所以曼哈顿博士也同样强于佩尔佩图阿。